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[方法验证及确认] qPCR磁珠法提取样本残留DNA,Taqman探针法检测样本残留DNA

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药徒
发表于 2020-10-13 15:03:17 | 显示全部楼层 |阅读模式

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大家好,请教一下:
①用磁珠法提取样本中的DNA时,在DNA的结合、洗涤、洗脱这三个步骤中,将1.5ml离心管放到磁力架上时,发现管内的磁珠聚集程度不是太好。大部分磁珠是聚集成一个圆点出现在管的中间,但有部分磁珠呈拖尾状出现在靠近管底处,在磁力架上转动离心管也不能让拖尾的磁珠来到管子中间,给吸取上清液带来了很大的干扰。这个情况是不是在离心过程中,速度太大时间太长导致?还是与1.5ml离心管有关?
1.5ml离心管的信息是:Axygen的低吸附系列MCT-150-C-L(我能确定不是勿用了Axygen的非低吸附系列MCT-150-C)
试剂盒的信息是:中检院出售的试剂盒
②配制qPCR MIX反应液后,在分装至八连管过程中,多次吸液时发现MIX黏在吸头里情况很常见的且不易排出,还容易在吸头内产生气泡,给吸液的准确性带来了很大的干扰。这个情况是跟吸头有关吗?
吸头的信息是:Mettler Toledo的rainin系列的LTS低吸附20μl的吸头RC-LTS-20μl-L(我能确定不是勿用了rainin系列的LTS非低吸附20μl的吸头RC-LTS-20μl),配套的是Mettler Toledo的rainin系列的LTS移液器。配制qPCR MIX反应液时因体积大,而同系列别的大规格的吸头就不太出现黏附的情况。
试剂盒的信息是:中检院出售的试剂盒


各位有什么好的经验可以分享不?感谢
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药徒
发表于 2020-10-13 15:28:26 | 显示全部楼层
码住,回头来看回答
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发表于 2023-1-19 14:29:04 | 显示全部楼层
第一个问题,可以先用大枪头吸一次,再用小枪头吸一次。第二个问题,建议用电动排枪,手动排枪的话需要润枪,操作需要技巧,平时要多练习多观察。
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药徒
发表于 2024-10-14 17:59:17 | 显示全部楼层
磁珠聚集问题,可以考虑更换磁力架;mix过于粘稠,使用低吸附枪头用反向移液法移液
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药徒
发表于 2024-10-14 19:24:29 | 显示全部楼层
换个磁力大点的磁力架,裂解液加多点不知道能不能解决,还有就是孵育温度的问题
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